Sinopse : A 2ª Temporada começa 18 meses após o final da primeira temporada. Desde a morte de sua mulher, Jack Bauer permaneceu inativo, afastado de seu trabalho e desaparecido em uma grave depressão, provocando, assim, um afastamento de sua filha.
Nesse mesmo período, David Palmer é eleito presidente dos EUA.
Porém, Bauer é chamado de volta a UCT quando descobre-se que um grupo terrorista planeja detonar uma Bomba Nuclear em Los Angeles.
Uma missão secreta realizada por Jack Bauer há alguns anos pode ser relevante para a investigação, porque necessitará que volte a estabelecer alguns dos antigos contatos e encontrar os responsáveis diretos desta nova ameaça terrorista que parece ser vinculada a grupos islâmicos. A segunda temporada mostra a tentativa de detonação de uma bomba atômica na cidade de Los Anges e todos os seus desdobramentos.
Ao final da temporada, quando tudo caminhava para um final feliz, o presidente Palmer é vítima de um atentado.